Zli Lord Eradikus je pobijedio galaksiju i sada je na svom pobjedničkom krugu kroz sektor u svo brodu, Eradikusu Primeu. On može vladati željeznom pesnicom, ali njegovi najcjenjeniji artefakti ipak će iscuriti iz njegovih kiborških pandži. Vi i vaša lopovska družina izazvali ste jedni druge da se ušuljate na njegov brod, hakirate put do njegovog zapovjednog modula i ukradete mu ga.

Usput ćete regrutirati saveznike i zgrabiti dodatni plijen. Ali jedan pogrešan korak i … Clank! Naočigled nebitna buka privlači pozornost Lorda Eradikusa. Hakiranje njegovog komandnog modula i krađa njegovih artefakata samo povećavaju njegov bijes. Bolje se nadaj kako su tvoji prijatelji glasniji od tebe, ako želiš stići do kapsule za bijeg i izaći živ …

Clank! In! Space! je izrađen po istom principu igre kao Clank !: A Deck Building Adventure, gdje igrači stvaraju vlastite kupove karata tijekom igre s karticama koje im omogućuju da se kreću kroz svemirski brod, napadaju stvari, stječu nove karte, i – oh da – stvaraju buku koja privlači Lorda Eradikusa s čime će si, moguće zapečatiti put u vlastitu propast.